Essa pergunta foi parcialmente respondida aqui. Lembre, mais importante que o método, é a pergunta que você está tentando responder: Veja essa discussão aqui e aqui.
Busque disciplinas extras de estatística e algoritmos ou ciência da computação. Quanto mais você souber desses tópicos, mas fácil você achará lidar com econofísica.
É difícil indicar referências específicas sobre o assunto sem saber em que área você está interessado. Algumas coisas clássicas da área, você pode encontrar:
Redes Complexas
Modelos baseados em agentes
Teoria tendo como base dados