Não acho que as propostas de complexidade em economia tentem resolver problemas de econometria. De fato, acho que essas propostas propõem uma nova rota para responder perguntas em economia e que de pouco em pouco vão sendo agregados a teoria econômica.
Vejo que o maior problema de econometria é como lidar com endogeneidade. De fato, a parte mais importante um trabalho empírico é encontrar uma boa rota para identificação. Pelo menos que eu saiba não existe nenhuma proposta da teoria de complexidade nessa direção.
Eles sugerem especialmente duas abordagens (várias delas interessantes):
1) Modelos baseados em agentes
2) Redes complexas
Acho que sua pergunta tem relação com essa pergunta.
Gostaria de finalizar dizendo que embora ache esses modelos acima super interessantes, a maioria da literatura que usa esses modelos e aplica a economia, despreza a parte mais importante do modelo econômico que é como os agentes fazem escolhas. Isso ocorre por dois motivos: falta de conhecimento de economia (a maioria dos artigos que usam essas metodologias não são economistas) e dificuldade de incluir explicitamente a escolha.
Fizemos um trabalho baseados em agentes há alguns anos atrás que explicitamente inclui a escolha do bancos. Esse trabalho está aqui. Ele foi publicado como "Interbank network and regulation policies: an analysis through agent-based simulations with adaptive learning, published in the Journal Of Network Theory In Finance, v. 2, n. 4, p. 53–86, 2016", mas está disponível online aqui.